光合细菌细胞内只有一个光系统,即PSI,光合作用的原始供氢体不是水,而是H2S （或一些有机物）,这样它进行光合作用的结果是产生了H2,分解有机物,同时还能固定空气的分子氮生氨.光合细菌在自身的同化代谢过程中,又完成了产氢、固氮、分解有机物三个自然界物质循环中极为重要的化学过程.