微生物包括原生动物,还包括原核生物,病毒,真菌,显微藻类等.
在原始的分类中,生物只分为动物和植物两界,那时把原生动物归入动物界.
而后,随着分类学的逐步发展,在现在中国比较承认的五界系统中,原生动物属于原生生物界.
微生物是一个模糊的概念,意思是肉眼看不见或看不清的微小生物的总称,不属于分类学概念.