现在质粒提取无论手提还是试剂盒,其根本原理还是碱裂解法：当菌体在NaOH和 SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中；蛋白质与染色体DNA不变性 而呈絮状,离心时可沉淀下来.
这就把基因组DNA去掉了.