[H]中e并不是由水直接提供的,而是叶绿素a中的.
光合作用系统由多种色素组成,如叶绿素a(Chlorophyll a)、叶绿素b(Chlorophyll b）、类胡萝卜素(Carotenoids）等组成.既拓宽了光合作用的作用光谱,其他的色素也能吸收过度的强光而产生所谓的光保护作用(Photoprotection）.在此系统里,当光子打到系统里的色素分子时,会如图片所示一般,电子会在分子之间移转,直到反应中心为止.反应中心有两种,光系统一吸收光谱于700nm达到高峰,系统二则是680nm为高峰.反应中心是由叶绿素a及特定蛋白质所组成（这边的叶绿素a是因为位置而非结构特殊）,蛋白质的种类决定了反应中心吸收之波长.反应中心吸收了特定波长的光线后,叶绿素a激发出了一个电子,而旁边的酵素使水裂解成氢离子和氧原子,多余的电子去补叶绿素a分子上的缺.然后叶绿素a生产ATP与NADPH（还原型辅酶）分子,过程称之为电子传递链(Electron Transport Chain）.