A、（x-y）（-x+y）=-（x-y）（x-y），两项都相同，不符合平方差公式．故本选项错误；
B、（x³-y³）（x³+y³）中的两项都是一项完全相同，另一项互为相反数，符合平方差公式．故本选项正确；
C、（-x-y）（x-y）=-（x+y）（x-y），它中的两项都是一项完全相同，另一项互为相反数，符合平方差公式．故本选项正确；
D、（x²-y²）（-y²-x²）=-（x²-y²）（x²+y²），它中的两项都是一项完全相同，另一项互为相反数，符合平方差公式．故本选项正确；
故选A．