A
I can not understand 【why she left 】the boy alone.
这是why 引导的宾语从句,要用陈述句语序,故首先排除倒装语序 B,D
继而可以排除C,因为此句没有特定的过去时点,当然也就没有【过去的过去】,即【过去完成时】