气泡或者裂缝会造成谱带之间的界限倾斜、模糊.尤其是裂缝引起的填料断层会造成沟流,使得组分之间混合,严重影响分离效果.装柱不均匀会降低柱子的分离效率：填料太松散,流动相速度太快,组分没有在两相之间充分达到吸附溶解平衡,降低会塔板数,分离不完全；太紧密不仅流动相过柱速度慢,也会造成组分在固定相中扩散,使得谱带加宽,甚至重叠.