首先更正你的说法.
氨分子是极性分子,甲烷是非极性分子.
氨是一个氮原子与3个氢原子构成的四面体,不是正四面体,所以是极性分子.
甲烷分子的空间结构为正四面体,C原子位于结构的中间,微带负电,4个H原子位于四周,各微带正电,但由于正四面体为空间对称结构,H原子的正电荷的作用总点与C原子位置重合,故整体为非极性.