藻类颜色和藻体内不同种类色素的含量差异有关：
1、绿藻：藻体内色素中以叶绿素a和b最多,还有叶黄素和胡萝卜素,故呈绿色.
2、红藻：除了含叶绿素a和叶绿素b、胡萝卜素和叶黄素外,还含有藻红素和藻蓝素,以藻红素占优势,故藻体呈红色或紫红色.
3、褐藻：含叶绿素a和c、胡萝卜素及数种叶黄素（主要是墨角藻黄素）,由于叶黄素的含量超过别的色素,故藻体呈黄褐色或深褐色.