根据我的做题经验和体会,我总结出来有以下几点区别.
1、首先明确,物质与意识的辩证关系是唯物论的内容,实践与认识的辩证关系是认识论的内容.如果题目中所问的是“用唯物论的相关知识回答”就不回答实践与认识的辩证关系.而如果问“用认识论的相关知识回答”自然也就不回答物质与意识的辩证关系.
2、物质和实践,意识和认识有一定相似之处,但是是不同的概念.物质与意识的关系问题是哲学的基本问题,是一切哲学都不能回避的.物质与意识的辩证关系原理无论自然界,人类社会还是人的思维方面都是适用的.而实践与认识的辩证关系则不同.实践的主体必须是人.时间也是处在主观与客观交汇点上的.因而实践和认识的辩证关系也只用于回答人类社会中的一些问题.
3、二者的内容以及对应方法论也有所差异.物质与意识的辩证关系说的是“物质决定意识,意识对物质具有能动的反作用.反作用主要体现在,对认识世界改造世界有指导作用.这要求我们一切从实际出发,实事求是”而实践与认识的辩证关系说的是“实践决定认识,认识对事件具有能动的反作用.主要表现在：实践是认识的基础,实践是认识发展的动力,实践是检验真理的唯一标准,实践是认识的归宿”.这样展开来看,这二者说的内容实际上是不同的.
4、不过还要结合具体问题具体分析.这个要在练习中不断感悟摸索.希望我的回答对你有所帮助.