黄山位于第三阶梯,花岗岩,为群山构造
安徽省和黄山地质工程勘察院的资料显示：大约6、7千年前,花山一带地质出现断层,江水及天然降雨慢慢渗入本区,在地下储积层经过一系列演变后逐渐形成含水岩.随着岩层挤压并受地热的影响,带有大量矿物质的地下热水外涌而出,从而形成温泉水.
云海的形成,有其原因和规律.黄山山高谷低,林木繁茂,日照时间短,水分不易蒸发,因而湿度大,水气多.雨后常见缕缕轻雾,自山谷升起.全年平均有雾天250日左右,真可谓云雾之乡.黄山云海是由低云（云底高度低于2500米）和地面雾形成的.低云主要是层积云,这是其特点