动物转录组测序数据中,singleton可以说是不能组装的单一read吗?
contig是由reads组装而成,那么不能组装的reads是不是就是singletons?即contig和singleton都是unique sequence?
还有一种说法：singleton是指无法和其他片段匹配的单一的reads,或者contigs,或者scaffold.上述两种有关singleton的说法哪个对?
人气：413 ℃ 时间：2020-08-27 05:58:27
解答
singleton可以说是不能组装的单一read.这个名词是对于454来说的,第一种说法比较正确,因为454的读长较长,拼接不上的单一reads也是有分析价值的.
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