醋酸菌可以制醋,霉菌可用于制作酱油和酱,现在酿酒还可以用酒曲,
青霉菌产生的青霉素,可治疗肺炎,脑膜炎,淋病等多种细菌性疾病,而青霉菌产生的灰黄霉素,可用来治疗由真菌引起的头癣.足癣.甲癣等,利用转基因工程产生转基因细菌,使这些细菌能够生产药品来治疗某些人类疾病.如科学家利用现代技术手段将控制合成胰岛素转入大肠杆菌内,对大肠杆菌进行大规模培养,使之大量生产胰岛素来治疗糖尿病.
有些细菌会导致人类患病.比如肺炎双球菌使人患肺炎,链球菌使人患扁桃体炎,猩红热,丹毒等多种疾病.