A、NH₄HC0₃中只有一种营养元素氮元素．故选项错误；
B、KNO₃中含有钾元素和氮元素两种营养元素．故选项正确；
C、Ca₃（P0₄）₂中含有一种营养元素磷元素．故选项错误；
D、K₂S0₄中含有一种营养元素钾元素．故选项错误．
故选B．