一部分微生物是专性厌氧如乳酸菌,大肠杆菌,破伤风杆菌,一些寄生在其它生物体内的寄生虫也是进行无氧呼吸如蛔虫等,自养型的生物大多进行有氧呼吸,另外进行有氧呼吸的生物大多都保留了无氧呼吸的机制.