A、品红放入一杯水中，整杯水都会变红，说明了分子是运动的．故A不符合题意；
B、在室内，同样表面积的热水比冷水蒸发的快是因为分子不断运动且运动速度与温度有关，温度越高，运动速度越快．故B不符合题意；
C、氧化汞受热分解生成汞和氧气，说明了分子在化学变化中可以再分，不能说明分子是运动的．故C符合题意；
D、医院里充满了酒精味和药味是因为分子不断运动到人的鼻孔，刺激嗅觉细胞，使人闻到了酒精味和药味．故D不符合题意．
故选C．