根据题意，AB=AC=5cm，
∴CE=3cm，
∵⊙O是△ABC的内切圆，
∴CF=CE=3cm，
在Rt△ACE中，由勾股定理求得AE=4cm，AF=2cm；
∵OF⊥AC，
∴△AOF∽△ACE，
∴OF：CE=AF：AE，即OF：3=2：4，OF=1.5cm，
∴圆的半径是1.5cm．