A
还没有决定他们什么时候会开始这个项目

连接词Whether引导主语从句时,表示主语从句的不确定性,但从句中不作成分,但有意义,作“是否”的意思.例如：
Whether he will go is not known.
不知道她是否会去.
Whether we will go camping tomorrow depends on the weather.
我们明天是否能去露营取决于天气.

连接副词when有意义,并在从句中作状语.例如：
When they will start the project has not been decided yet.
还没有决定他们什么时候开始项目.

其实两个答案应该都可以,如果非要选一个的话,when应该比较恰当一些.