A、缺失核苷酸的位置在基因的中部，所以缺失位置之前的基因仍能正常表达形成相应的蛋白质；故A错误．
B、基因的中部缺失了一个核苷酸对，有可能使其转录的信使RNA上的密码子在这个位置上开始发生变化，变成终止密码子；故B正确．
C、核苷酸对缺失后，在这个位置上的密码子变成终止密码子，这样翻译过程就可能在缺失位置终止，从而使所控制合成的蛋白质减少多个氨基酸；故C正确．
D、基因的中部缺失了一个核苷酸对，有可能使其转录的信使RNA上的密码子在这个位置上开始发生变化，致使翻译所形成的蛋白质在缺失部位以后的氨基酸序列发生变化；故D正确．
故选A