多音字是古代由于地域差异而形成的.古时候交通不发达,各个地区之间的文化交流不方便,因此形成了多国语言,类似现代的方言.秦统一六国时统一文字,原来各国不同的文字统一为统一的小篆和隶书.
在读音上,由于汉字的演变和分化每个字失去了他原来的意义,因此造成了多种多样的语音差别.
有兴趣的话可以参照和王力等著名语言家的著作.