因为x和y都是自然数，x÷y=3，（y≠0）
所以x和y成倍数关系，x是较大数，y是较小数，
因此x和y的最大公因数是y，最小公倍数是x；
再根据正比例的特点，因为x÷y=3，（y≠0）
两个变量的比值一定，那么这两个变量成正比例关系．
故答案为：y，x，成正．