（1）1999-1998+1997-1996+…+3-2+1
=（1999-1998）+（1997-1996）+…+（3-2）+1
=1+1+…+1+1
=1×999+1
=999+1
=1000；
（2）1000-99-98-97-96-95-5-4-3-2-1
=1000-（99+98+97+96+95+5+4+3+2+1）
=1000-[（99+1）+（98+2）+（97+3）+（96+4）+（95+5）]
=1000-[100+100+100+100+100]
=1000-500
=500．
故答案为：1000，500．