A、铝属于金属晶体，能与氢氧化钠溶液反应，是单质不是化合物，故A错误；
B、金刚石属于原子晶体，不能与氢氧化钠溶液反应，是单质不是化合物，故B错误；
C、硅属于原子晶体，能与氢氧化钠溶液反应，是单质不是化合物，故C错误；
D、二氧化硅属于原子晶体，能与氢氧化钠溶液反应，是化合物，故D正确；
故选D．