A、姐妹染色单体分离发生在减数第二次分裂后期，是复制关系，形成相同的染色体和基因，A错误；
B、由于亲代白绵羊都是杂合体，在减数分裂形成配子时，等位基因分离，产生两种不同的配子，B正确；
C、绵羊的白色和黑色是由一对等位基因控制的，在减数分裂过程中没有发生基因重组，C错误；
D、白绵羊与白绵羊交配，后代出现了白绵羊和黑绵羊，这种现象称性状分离，但不是产生这种现象的根本原因，D错误．
故选：B．