一般要根据要电泳分离的核酸的分子量大小：分子量大的核酸电泳时使用浓度较小的凝胶,分子量小的核酸电泳时使用浓度较大的凝胶.核酸在浓度越大的凝胶中电泳速度越小.如果胶浓度偏高,可能跑不动,如果胶浓度偏低,可能跑得太快,分不开.
可以查到核酸分子大小与琼脂糖浓度范围的对应关系.