您,代词,是对人的一种尊称
你,只是一个代词,没有其他意义
所以,您们好,是指对所要打招呼的所有人表示尊敬
而你们好,则不包含这个意思,纯粹的打招呼而已
只所以提问者感觉别扭,是因为你从发音的角度,觉得发音比较别扭.而不同的地区不同的方言,说出来的"您们好"并不是一个音准,所以并不是所有人都感觉别扭.