一、乙酸——丙二酸途径：生成脂肪酸类、酚类、醌类化合物.
二、甲戊二羟酸途径：生成萜类、甾类化合物.
三、莽草酸途径：具有C3——C6及C6——C1基本结构的化合物有这一途径衍化而成.如苯丙素类、木脂素类、香豆素类等.
四：氨基酸途径：大多数生物碱类成分由此途径生成.
五：复合途径：分子中各个不同部分由不同的生物合成途径产生.如查尔酮类、二氢黄酮类化合物的A环和B环分别由乙酸——丙二酸途径和莽草酸途径生成.一些萜类生物碱分别来自甲戊二羟酸途径和莽草酸途径或乙酸——丙二酸途径.