首先,看测序峰图,如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的,碱基所对应的编码是一致的,那么可以判断序列是可以使用的.如果出现双峰,信号中断等异常现象,那么需要重新制备或者克隆后再测序.
其次,将PCR产物在NCBI上blast,看是否与你预期想要的片段符合,如果是匹配度一致,那么可以进行下一步,例如克隆,表达等.如果是匹配度不高,那么建议重新制备,最好是采用touchdown或巢式PCR等方法,提高产物的特异性后再扩增测序.
另外,如果是做SNP分析的,那么需要你通过看测序彩图,找出相应的突变杂合位点.