微生物是指一切肉眼看不到或看不清楚，因而需要借助显微镜观察的微小生物．微生物包括原生动物、真菌和细菌、病毒．土壤具有微生物生长繁殖所需要的一切营养物质及各种条件，因此土壤是微生物良好的生活场所，有“微生物的天然培养基”之称．可见D选项正确．
故选：D