①乳酸菌是原核生物，除了细胞膜外，没有核膜和具膜细胞器，①正确；
②变形虫是真核生物，除了细胞膜外，还有核膜和具膜细胞器，②错误；
③肺炎双球菌是原核生物，除了细胞膜外，没有核膜和具膜细胞器，③正确；
④蓝藻是原核生物，除了细胞膜外，没有核膜和具膜细胞器，④正确；
⑤酵母菌是真核生物，除了细胞膜外，还有核膜和具膜细胞器，⑤错误．
故选：C．