1、根据细菌形成的菌落的形态特征进行菌种鉴定；
2、直接在显微镜下观察,进行鉴定；
3、分子生物学鉴定,即通过测定细菌的基因进行鉴定；
4、通过分析细菌的功能蛋白进行鉴定；