1、真核生物有核膜包被,原核生物没有.
2、真核生物有线粒体、叶绿体、高尔基体、核糖体等,原核生物只有核糖体.
3、真核生物是由原核生物进化来得.
可以从名称上区别：首先要判断有无细胞结构,无细胞结构的是病毒.有细胞结构的前提下判断是不是原核生物,原核生物有细菌、某些藻类、衣原体、支原体.如果在“菌”字前有“杆”“球”“螺旋”“弧”“细”字为细菌（乳酸菌、醋酸菌和固氮菌除外）,其余为真菌,真菌为真核.藻类中记住蓝藻、颤藻、念珠藻为原核其余为真核就行了.
从结构上区别：
真核细胞：有核膜（有成形的细胞核）和多种细胞器
原核细胞：无核膜（无成形的细胞核）细胞器只有核糖体