胚胎由囊胚继续发育,由原始的单胚层细胞发展成具有双层（外胚层和内胚层）或三层（外胚层、中胚层和内胚层）胚层结构的胚胎,称为原肠胚.从扁形动物开始,多细胞动物的胚胎发育过程出现了中胚层,从而引起了身体结构上的复杂分化,这在动物的进化史上是个重大的发展.中胚层的发生,引起了动物身体结构上一系列组织、器官和系统的分化,为动物身体结构的发展和器官功能的进化创造了条件.