A、具有催化作用的酶是由氨基酸或核糖核苷酸组成的，A错误；
B、生命活动所需要的氨基酸有20种，是根据R基不同而划分的，20种氨基酸中，有高等动物能合成的13种非必需氨基酸，还有7种氨基酸是高等动物不能合成的必需氨基酸，B错误．
C、细胞中氨基酸的种类和数量相同，氨基酸的排列顺序和蛋白质的空间结构不一定相同，因此氨基酸种类和数量相同的蛋白质不一定是一种蛋白质，C错误；
D、细胞分化的实质是基因的选择表达，基因表达的结果产生蛋白质，在胚胎发育过程中，由于基因选择性表达，细胞会产生新的蛋白质，D正确．
故选：D．