最常见的是大肠杆菌和酵母菌
1.硝化作用的微生物：亚硝酸细菌：亚硝酸单胞菌、亚硝酸球菌、亚硝酸螺旋菌、亚硝酸叶状菌、亚硝酸弧菌.硝酸细菌：硝酸杆菌、硝酸针状菌、硝酸球菌.
1.反硝化作用的微生物：假单胞菌、产碱杆菌、芽孢杆菌、硫杆菌属、脱氮硫杆菌、红假单胞菌、副球菌属、布兰汉氏菌属,奈氏球菌属.
3.硫化作用的微生物：硫化细菌、丝状硫细菌和光能自养硫细菌.
4.反硫化作用的微生物：脱硫弧菌.