A、限制酶用于切割获取目的基因和运载体，A错误；
B、一般用同一种限制酶处理载体与目的基因，形成相同的粘性末端，B正确；
C、基因工程所用的工具酶是限制酶，DNA连接酶，C正确；
D、采用DNA分子杂交的方法检测带有目的基因的载体是否进入受体细胞，D正确．
故选：A．