A、目的基因与质粒在DNA连接酶作用下结合的过程属于基因重组，A错误；
B、质粒上至少要有一个标记基因，而标记基因不一定是抗性基因，也可以是荧光基因，B错误；
C、没有与目的基因重组的普通质粒也可以进入受体细胞，C正确；
D、用质粒作为运载体时，质粒上的目的基因不需要整合到受体细胞的DNA上，用病毒或噬菌体作为运载体时，目的基因需整合到受体细胞DNA上，D错误．
故选：C．