湄公河三角洲流域位于亚洲热带季风区的中心,5～9月底受来自海上的西南季风影响,潮湿多雨,5～10湄公河三角洲
月为雨季；11月～次年3月中旬受来自大陆的东北季风影响,干燥少雨,11月～次年4月为旱季. 　　强度很大、历时较短、影响范围较小的雷雨在整个雨季都很频繁；历时较长,范围很大的降雨在9月份最频繁,能引起严重的洪水泛滥,但其影响大多只局限于三角洲地区和流域西部,偶而穿越大陆使更大范围遭受长时间大雨袭击.由于降雨的季节分布不均匀,流域各地每年都要经历一次强度和历时不同的干旱.