A、甲豌豆（yyRr）×Yyrr→后代表现型有四种，且比例为（3：1）×（1：1）=3：3：1：1，A正确；
B、甲豌豆（YyRr）×YyRR→后代表现型有2种，且比例为（3：1）×1=3：1，B错误；
C、甲豌豆（YyRr）×yyRR→后代表现型有四种，且比例为（1：1）×1=1：1，C错误；
D、甲豌豆（YyRr）×YyRr→后代表现型有四种，且比例为（3：1）×（3：1）=9：3：3：1，D错误．
故选：A．