摩尔根培养红眼果蝇进行遗传实验，培养若干代后，偶然发现了一只白眼雄果蝇，说明这些红眼果蝇是纯种，不可能重组出白眼性状，而染色体变异产生的改变幅度较大，所以该变异应该是基因突变，红眼基因突变为白眼基因所致．
故选：A．