A、DNA分子结构的多样性取决于碱基对排列顺序的多样性，A错误；
B、生物界丰富多彩的根本原因是DNA分子具有多样性，B正确；
C、蛋白质的多样性体现了生物界多样性，C正确；
D、蛋白质的合成离不开RNA，且mRNA是蛋白质合成的直接模板，因此没有RNA的多样性就没有蛋白质的多样性，D正确．
故选：A．