ABD、可遗传的变异是生物进化的原始材料、自然选择决定生物进化的方向和自然选择是环境对生物的选择是现代进化论与达尔文进化论观点的相同之处，ABD错误；
C、种群基因频率的改变是生物进化的实质，是现代进化论与达尔文进化论观点的不同之处，C正确．
故选：C．