不太一样的.
hatch:n.舱口（建筑物屋顶或地板上的开口,或在船的甲板或飞机上）；v.孵化--此处指孵出来,重点是出来.hatch还有think out and produce (a plot,plan,etc)策划（阴谋）,拟订（计画）的意思
而incubate:v.keep (eggs) warm,usu by sitting on them,until they hatch-----指的是"孵化"这一过程,重点是孵化.另外incubate还有（使某事物）逐渐发展,酝酿的意思.
简单来说,母鸡坐在蛋上等着就是incubate,小鸡从里面出来就是hatch,在孵蛋这回事儿上差不多可以互通.还是要根据上下文.