A、NaOH和HNO₃能结合生成水，不能共存，故A错误；
B、MgCl₂和KOH能结合生成氢氧化镁沉淀，不能共存，故B错误；
C、Na₂CO₃和HCl能结合生成二氧化碳和水，不能共存，故C错误；
D、H₂SO₄、NaCl和Cu（NO₃）₂这三种物质间相互不反应，能共存，故D正确；
故选D．