细菌都是单细胞的，故①说法正确；细菌的个体十分微小，大约1000个细菌排成一排才有1毫米长，故②说法错误；细菌的基本形态有球状、杆状和螺旋状三种，故③正确；细菌没有菌丝，一般真菌具有菌丝，故④说法错误；细菌通过分裂的方式进行繁殖，故⑤说法正确；当环境变得不利于细菌生长时，有些细菌能够形成一个椭圆形的休眠体，即芽孢，故⑥说法正确．
故选B