常见的对蛋白质有分解能力的酶有胃蛋白酶、胰蛋白酶等,分解产物为多肽.生物体内普遍存在蛋白酶，除了上述的还有角蛋白酶、胶原蛋白酶等，主要是产生的生物种类（如胃蛋白酶、胰蛋白酶在动物体内，木瓜蛋白酶在植物体内）不同，分布的部位不同，各自的合适PH、温度有差异（如胃蛋白酶适宜酸性条件、胰蛋白酶适宜微碱性条件），不好说谁更有优势。