波长不同：蛋白在280 nm,核酸在260 nm.这取决于生色团,即分子结构.
均一性不同：核酸的每种碱基都有吸收,而且相差不多,因而定量时线性很好；蛋白的20种构件中只有三种有吸收,相互差异也较大,所以蛋白用紫外吸收定量比较困难.
另外,紫外吸收光谱是由分子中价电子能级跃迁所产生的.是吸收,不是衍射.