在动物细胞内有两个穿梭系统,一是磷酸甘油穿梭系统,主要存在于动物骨胳肌、脑及昆虫的飞翔肌等组织细胞中；二是苹果酸穿梭系统,主要存在于动物的肝、肾和心肌细胞的线粒体中.
二者发生的位置不同