在题干中的生态系统中，水稻为植物属于生产者，而害虫和青蛙为动物属于消费者，它们之间存有吃与被吃的关系，构成一条食物链，即：水稻→害虫→青蛙，如果大量捕捉青蛙，以至稻田里害虫大量繁殖，破坏了食物链，导致生态平衡失调，使害虫增加，水稻减产．
故选：D