细胞膜上存在两类主要的转运蛋白,即：载体蛋白（carrier protein）和通道蛋白（channel protein）.
载体蛋白又称做载体（carrier）、通透酶（permease）和转运器（transporter）.能够与特异性溶质结合,通过自身构象的变化,将与它结合的溶质转移到膜的另一侧.载体蛋白有的需要能量驱动,如：各类ATP驱动的离子泵；有的则不需要能量,以自由扩散的方式运输物质,如：缬氨酶素.这里要注意,之所以称为通透酶,是因为它与所运输物质之间有对应关系,特意性强.
通道蛋白与所转运物质之间的结合较弱,它能形成亲水的通道（可以想象为亲水的孔,如porin）,当通道打开时能允许特定大小的溶质通过,特异性不如载体蛋白强.所有通道蛋白均以自由扩散的方式运输溶质,不消耗能量.